全会員の総意を表す議決機関が総会で、会務の実際の運営、執行は理事会（理事45名、互選により会長1 名、副会長2名）によって行われています。理事会を補佐するために幹事会が設けられています。このほか会長の諮問機関として評議委員会があり、会務・会計監査のため監事が選任されています。
| 会長 | 和佐田 演愼 | （独）石油天然ガス・金属鉱物資源機構 |
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| 副会長 | 川口 健一 | 国際石油開発帝石(株) |
| 副会長 | 佐溝 信幸 | アラビア石油(株) |
| 会誌編集委員長 | 佐藤 徹 | 石油資源開発(株) |
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| 探鉱技術委員長 | 棚橋 学 | （独）産業技術総合研究所 |
| 作井技術委員長 | 市川 祐一郎 | 日本海洋掘削(株) |
| 生産技術委員長 | 村橋 庸也 | 石油資源開発(株) |
| 国際委員長 | 大野 健二 | 伊藤忠石油開発(株) |
| 資源経済委員長 | 岩間 剛一 | 和光大学経済経営学部 |
| ホームページ委員長 | 川口 健一 | 国際石油開発帝石(株) |
組織の形態は下記リンク先に示すとおりです。
